使用全長蛋白質作為抗原更有針對性，但仍然存在問題。

在這項初步工作后不久，Nairn 及其同事描述了一種特異性針對 G 底物磷酸化形式的抗體的產生，G 底物是一種定位于小腦浦肯野細胞并被 cGMP 依賴性蛋白激酶磷酸化的蛋白質 (2)。該抗體是通過體外磷酸化的純化G-底物磷蛋白對家兔進行免疫接種而制備的。. 盡管取得了初步成功，但通過用完整蛋白質的磷酸形式免疫來生產磷酸特異性抗血清的其他嘗試并不十分成功，這可能是因為兩個重要因素。首先，據信許多磷酸化蛋白質在免疫過程中會快速去磷酸化，無論注射途徑如何，都會導致所需磷酸化表位的丟失。其次，全蛋白通常含有多個免疫原性表位。由于磷酸位點只是這種長蛋白質的一小段，因此針對全長蛋白質抗原的抗體識別感興趣的磷酸位點的可能性很低。